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科學(xué)家構(gòu)建首個水稻多器官單細(xì)胞多組學(xué)圖譜

本報北京7月16日電 (喻思南、崔艷)近日,中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院生物技術(shù)研究所聯(lián)合國內(nèi)外研究機(jī)構(gòu),構(gòu)建了首個水稻多器官單細(xì)胞多組學(xué)圖譜,系統(tǒng)解析了細(xì)胞類型的功能及其對復(fù)雜性狀的調(diào)控作用,并預(yù)測和挖掘出多個細(xì)胞類型特異的性狀調(diào)控基因,為水稻設(shè)計育種提供了細(xì)胞水平特異候選靶點(diǎn)。相關(guān)研究成果發(fā)表在《自然》雜志上。
水稻的根、莖、葉、種子等器官由多種功能細(xì)胞組成,這些細(xì)胞類型對水稻發(fā)育、產(chǎn)量與抗性都具有重要作用,但對其系統(tǒng)鑒定及功能解析進(jìn)展較慢。利用單細(xì)胞等新興技術(shù),從細(xì)胞層面系統(tǒng)刻畫不同器官的細(xì)胞類型與狀態(tài),解析其分子調(diào)控機(jī)制,可為解析水稻發(fā)育和重要農(nóng)藝性狀的形成提供新路徑。該研究對水稻8個器官中超過11萬個細(xì)胞的RNA表達(dá)與染色質(zhì)可及性狀態(tài)進(jìn)行了同步測序和深度分析,通過原位雜交實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證了54種細(xì)胞類型,并構(gòu)建了細(xì)胞類型特異的基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò),挖掘了系列細(xì)胞類型特異基因。同時,研發(fā)了水稻單細(xì)胞水平的基因擾動虛擬敲除、轉(zhuǎn)錄因子功能預(yù)測、細(xì)胞類型預(yù)測等算法、工具和模型。該研究為水稻單細(xì)胞水平智能設(shè)計育種提供了數(shù)據(jù)、基因和技術(shù)基礎(chǔ),為作物改良開辟了新途徑。
《 人民日報 》( 2025年07月17日 13 版)
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